Se describen los criterios para hacer el diagnóstico diferencial entre las diferentes amibas que parasitan el colon humano, se discuten los resultados de los estudios epidemiológicos realizados y publicados en México sobre estos parásitos y se presentan los resultados de una encuesta aplicada en varios hospitales de la Ciudad de México para investigar el estado actual del diagnóstico diferencial de los mismos. Se encontró que en los estudios publicados en México no se han reportado portadores de E. hartmanii. La encuesta mostró que en los hospitales donde se aplicó no se diferencia a la E. histolytica de la E. hartmanii. Se discute la posibilidad de que en México a la E. hartmanii probablemente se le confunda con la E. histolytica, por lo que la prevalencia de amibiasis intestinal asintomática se sobreestima. Se enfatiza la necesidad de hacer el diagnóstico diferencial entre ambos parásitos.